另外需要注意的是，天然的油脂和脂肪酸不是一種純凈物，而是多種不同碳鏈長度的脂肪酸的混合物，理論上脂肪酸包括了從甲酸（C1）到高級(jí)脂肪酸（C24），而生物柴油的主要成分是C16、C18、C20和少量的前級(jí)餾分（C12之前），不過其中C16、C18占了大約70%以上。
 

生物柴油雖然也被稱為“柴油”，但是從以上介紹我們知道，它與傳統(tǒng)意義上的柴油（石化柴油）在本質(zhì)上完全不同，生物柴油是一種酯，而石化柴油是烷烴，二者是完全不同的化學(xué)物質(zhì)，與石化柴油相比，生物柴油的性質(zhì)體現(xiàn)出以下優(yōu)勢(shì)、不足及相似之處：
 

1.2.1、碳鏈長度：生物柴油主要成分是C16、C18脂肪酸甲酯，與標(biāo)準(zhǔn)石化柴油（C16烷烴）相似。
 

1.2.2、十六烷值：生物柴油的十六烷值一般大于50，更優(yōu)于普通石化柴油（一般是45左右）。
 

1.2.3、熱值：生物柴油的理論熱值與石化柴油接近，大約相當(dāng)于石化柴油的92—95%，而實(shí)際熱值略低于石化柴油。
 

1.2.4、不含硫：作為一種燃料的重要評(píng)價(jià)指標(biāo)，尾氣SO2排放量是很關(guān)鍵的標(biāo)準(zhǔn)；生物柴油不含硫，這一點(diǎn)是其優(yōu)于石化柴油的重要特性。